Dr. Agnieszka Latosinska

Biografie

Agnieszka Latosinska, geboren 1988 in Polen, promovierte 2016 an der Charité-Universitätsmedizin Berlin.

Ihre Forschung wurde durch das von der EU finanzierte Marie Sklodowska Curie BCMolMed (Molekulare Medizin für Blasenkrebs) EID-Programm (FP7-PEOPLE-2012-ITN-317450) gefördert. Im Rahmen dieses äußerst wettbewerbsintensiven Projekts hatte sie die Möglichkeit, ihre Zeit zwischen akademischen und industriellen Laboren aufzuteilen und sich auf translationale Forschung zu konzentrieren. Es gelang ihr, analytische Arbeitsabläufe für die Proteomanalyse zu etablieren, die jeden Schritt von der Studienplanung, Probenvorbereitung, Datenanalyse, markierungsfreien/markierungsbasierten Quantifizierung, Dateninterpretation und Validierung abdeckten. Die Anwendung dieser Methoden führte zu einem besseren Verständnis des molekularen Mechanismus, der der Invasion von Blasenkrebs zugrunde liegt, gefolgt von der Identifizierung neuer, biologisch bedingter therapeutischer Ziele sowie Biomarker. Sie nahm an zahlreichen internationalen Konferenzen teil und erhielt für die präsentierten Arbeiten Reisepreise. Sie wurde nominiert und ausgewählt, 2014 an der prestigeträchtigen Tagung der Nobelpreisträger in Lindau teilzunehmen.

Inspiriert von der Notwendigkeit, die technologischen Entwicklungen der Grundlagenforschung in klinisch nützliche Lösungen umzusetzen, setzte sie nach dem MSCA-Stipendium ihre Arbeit bei der Mosaiques Diagnostics GmbH fort. Sie leitete Kooperationsprojekte im Bereich urogenitaler Krebserkrankungen, die von der Europäischen Kommission und dem BMBF (nationale Förderstelle) gefördert wurden. Darüber hinaus war sie an zahlreichen translationalen Projekten beteiligt, bei denen sie Proteomanalyse von Urin und Gewebe verwandte, um Biomarker für chronische Krankheiten zu definieren, die molekularen Mechanismen, die Krankheiten zugrunde liegen (im Zusammenhang mit malignen Erkrankungen des Urogenitalsystems und Herz-Kreislauf-Erkrankungen), besser zu verstehen und potenzielle therapeutische Ziele und Medikamente auf der Grundlage von Multi-Omics-Daten zur molekularen Profilierung (im Zusammenhang mit malignen Erkrankungen des Urogenitalsystems) zu finden. Darüber hinaus hat sie umfangreiche Erfahrung in der Beantragung von Förderanträgen sowie im Projektmanagement und -berichten gesammelt. Ihre beiden Förderanträge für die Ausschreibung SME-2 wurden mit dem Exzellenzsiegel ausgezeichnet.

Sie wurde 2018 mit einem Marie Sklodowska Curie Individual Fellowship (H2020-MSCA-IF-2017-800048) ausgezeichnet, wo sie die Proteomanalyse (in Kombination mit anderen Omics-Daten) weiter anwendet, um Mechanismen zu verstehen, die mit der Entwicklung von Prostatakrebs verbunden sind, und um molekular gesteuerte therapeutische Arzneimittelziele und Therapeutika zu definieren. Das Projekt wurde für die Bewertung im Rahmen des EU-Programms Innovation Radar ausgewählt, was das innovative Potenzial der vorgeschlagenen Arbeit und Ergebnisse hervorhebt.

Als Höhepunkt hat sie an mehr als 45 Veröffentlichungen zur klinischen Proteomanalyse mitgewirkt (darunter Forschungs- und Übersichtsartikel, Buchkapitel und andere), die mehr als 1614 Mal zitiert wurden (H-Index: 24). Aufgrund ihrer herausragenden Leistungen und Expertise fungierte sie als Gastredakteurin für die Sonderausgabe der führenden Zeitschrift Proteomics Clinical Applications mit dem Titel „Klinische Proteomik auf dem Weg zur Umsetzung“ (März 2019).

Ihr Hauptforschungsinteresse gilt der Anwendung von Proteomik-Technologien und systembiologischen Ansätzen zur Definition von Biomarkern und der Untersuchung der Krankheitspathophysiologie und von Arzneimittelzielen für chronische Krankheiten, wobei sie sich insbesondere auf das Verständnis der molekularen Mechanismen der Fibrose konzentriert, vor allem auf den zugrunde liegenden Kollagenumsatz.

LEHRPLAN DES LEBENS

Ausbildung

2013 – 2016 | Charité-Universitätsmedizin Berlin, Berlin, Deutschland

• Grad: Doktor der klinischen Wissenschaften, Doctor rerum medicinalium (summa cum laude)
• Thema der wissenschaftlichen Arbeit: Optimizing methodologies for clinical proteomics

2010 - 2012 | Jagiellonen-Universität, Krakau, Polen

• Grad: Master of Science im Biotechnologie-Programm, 2012
• Thema der wissenschaftlichen Arbeit: Proteomic analysis of brain nuclear protein in pilocarpine model of temporal lobe epilepsy

2007 - 2010 | Jagiellonen-Universität, Krakau, Polen

• Grad: Bachelor of Science im Biotechnologieprogramm, 2010
• Thema der wissenschaftlichen Arbeit: Proteomic analysis of intrinsically disordered proteins

Berufserfahrung

Leitende Wissenschaftler | MOSAIQUES DIAGNOSTICS GMBH, HANNOVER, DEUTSCHLAND | April 2020 – heute

• Proteomik-basierte Projekte, vor allem im Bereich der Herz-Kreislauf-Erkrankungen sowie Krebs || Analyse hochauflösender CE-MS- und LC-MS/MS-Daten || Durchgeführte statistische Analysen || Entwicklung von Biomarker-Panels (Algorithmen für maschinelles Lernen) || Neuverwendung von Medikamenten auf Basis molekularer Daten || Bioinformatik-Analyse || Verbreitung || Zuschusseinreichung || Berichterstattung || Projektmanagement.

H2020 MSCA Fellow | pcaprotreat (IF-Programm) | MOSAIQUES DIAGNOSTICS GMBH, HANNOVER, DEUTSCHLAND | April 2018 – März 2020

• Marie-Sklodowska-Curie-Maßnahmen, gefördert durch die Europäische Kommission (H2020-MSCA-IF-2017-800048) || Integration von Multi-Omics (Proteomik, Peptidomik, Transkriptomik) und Daten aus mehreren Quellen (Gewebe, Urin, Samenplasma) || Statistische Analyse || Systembiologische Arbeitsabläufe || Vorhersage von Medikamenten/Verbindungen, die das Krankheitsbild umkehren können || Annotation und Auswahl potenzieller Medikamentenkandidaten und Medikamententargets || Multidisziplinäre Ausbildung.

Postdoktorand | Mosaiques Diagnostics GmbH, Hannover, Deutschland | Oktober 2017 – März 2018

• Auf Proteomik basierende Projekte || Analyse hochauflösender CE-MS- und LC-MS/MS-Daten || Durchgeführte statistische Analyse || Entwicklung von Biomarker-Panels (Algorithmen für maschinelles Lernen) || Verbreitung || Zuschusseinreichung || Berichterstattung || Projektmanagement.

Forschungspraktikum | Systems Biology Ireland (SBI) – University College Dublin, Dublin, Irland | Juli 2017 – September 2017

• Umfangreiche Ausbildung in systembiologischen Ansätzen.

Postdoktorand | Mosaiques Diagnostics GmbH, Hannover, Deutschland | Januar 2016 – Dezember 2016 & Februar 2017 – Juli 2017

• Proteomik-basiertes Projekt im Bereich Blasenkrebs, Prostatakrebs und Herz-Kreislauf-Erkrankungen || Analyse hochauflösender LC-MS/MS-Daten || Kritische Bewertung der Qualität von LC-MS/MS-Ergebnissen || Analyse hochauflösender CE-MS-Daten || Durchführung statistischer Analysen || Erstellung und Verteilung von Werbematerialien an verschiedene Zielgruppen || Berichterstattung || Verfassen von Zuschussanträgen || Projektmanagement.

PhD-Forscher, MSCA-Stipendiat | Bcmolmed (EID-Programm) | Biomedizinische Forschungsstiftung der Akademie von Athen, Athen, Griechenland | Januar 2013 – Januar 2016

• Optimierte und entwickelte Protokolle zur Probenvorbereitung für LC-MS/MS-Analyse (Gewebe, Zellen, Urin) || Etablierte Protokolle für subzelluläre Fraktionierung (ER/Golgi, Membran, Kerne, Sekretom) || Vorbereitete Proben für nachgelagerte Proteomikanalyse (SDS-PAGE, 2DE, LC-MS/MS) || Bewertete und verwendete Software für die Verarbeitung und Quantifizierung von LC-MS/MS-Daten || Analysierte LC-MS/MS-Daten (Proteome Discoverer, Trans-Proteomic Pipeline) || Führte eine funktionelle Annotation von Proteomikdaten sowie Pfad- und Netzwerkanalysen durch || Interpretierte und priorisierte Proteomik-Befunde || Untersuchte Mechanismen im Zusammenhang mit der Invasion von Blasenkrebs || Führte Zellkultur- und molekularbiologische Tests durch || Löste technische Probleme auf kreative Weise.
  

Redaktionelle und Gutachtertätigkeiten

• Gastherausgeber in Proteomics Clinical Applications: "Clinical Proteomics on the Way Towards Implementation", März 2019
• Gutachter für: Diagnostics, Journal of Personalised Medicine, Proteomes, Proteomics, Journal of Proteome Research, PLOS ONE, Scientific Reports

Preise und Auszeichnungen

• Zertifikat „Seal of Excellence“ für den Projektvorschlag 880256 mit dem Titel „An innovative Service to identify Molecularly-driven therapeutic agents and drug targets in Oncology“, eingereicht im Rahmen der zweiten Ausschreibungsphase des KMU-Instruments von Horizont 2020 (Juni 2019)
• Zertifikat „Seal of Excellence“ für den Projektvorschlag „Biomarker Guided Prostate Cancer Management“, eingereicht im Rahmen des KMU-Instruments von Horizont 2020, Phase 2 (Januar 2019)
• Internationaler BJU-Preis für die beste wissenschaftliche Arbeit mit dem Titel „A Urinary Peptide Biomarker Panel to Identify Significant Prostate Cancer“ (BAUS-Jahrestagung 2016, Liverpool, Großbritannien)
• Reisepreis für die Posterpräsentation mit dem Titel „Identification of proteins involved in invasion of bladder cancer using cell line models“ (22. Tagung der EAU-Sektion für urologische Forschung, Glasgow, Großbritannien)
• 64. Lindauer Nobelpreisträgertagung für Physiologie oder Medizin (Lindau, Deutschland, 2014)

Bisherige Finanzierung

• MSCA Individual Fellowship 2021: Disco-I HORIZON-TMA-MSCA-DN-ID (101072828)
• Eurostars-Projekt 2020-2023: ReDiRECt (E! 113726)
• MSCA-Einzelstipendium 2018–2020: PCaProTreat MSCA-IF-EF-SE EID-ITN (800048)
• Eurostars-Projekt 2017-2019: BioGuidePCa (E!11023)



Literaturverzeichnis

Link zu PubMed